Aufbau und Betrieb des Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hubs (DESH)

Motivation

Für die Planung von Maßnahmen zur Eindämmung der COVID-19-Pandemie ist die Kenntnis von Veränderungen des Erbgutes des Virus von besonderer Bedeutung. Diese können z. B. zu einer erhöhten Infektionswahrscheinlichkeit führen. So ist es hilfreich, einen detaillierten Überblick über die Ausbreitungsmuster spezifischer SARS-CoV-2-Mutationen zu erhalten und neue Mutationen frühzeitig zu entdecken.

Ziele und Vorgehen

Mit dem Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (kurz DESH) werden die Systeme zur bundesweiten Überwachung der COVID-19-Pandemie erweitert. Es wird eine digitale Plattform zur Übermittlung von Sequenzdaten aus allen Laboren des Bundesgebiets an das Robert Koch-Institut (RKI) aufgebaut und betrieben. Die so zentral zusammengeführten Daten können dort gemeinsam mit den epidemiologischen und klinischen Daten v. a. aus den Gesundheitsämtern analysiert werden.

Perspektiven für die Praxis

Mit der unmittelbaren Bereitstellung der am RKI zentral zusammengeführten Daten als Offene Daten über geeignete Schnittstellen, soll die Weiternutzung durch Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler und sonstige an den Daten Interessierte ermöglicht werden.